L’Istituto Comprensivo di Portoferraio è costituito complessivamente da 8 plessi dislocati sul territorio: 4 di Scuola dell'Infanzia, 3 di Scuola Primaria e uno di Scuola Secondaria di Primo Grado. Gli Uffici di Presidenza, gli Uffici Amministrativi ed il Centro Territoriale Permanente sono situati presso la sede della Scuola Secondaria di Primo Grado in Viale Elba, a poche centinaia di metri dal porto, e quindi facilmente raggiungibile anche a piedi per chi proviene da Piombino. Ugualmente raggiungibile in pochi minuti è la Scuola Primaria di San Rocco, situata su una traversa di via Carducci, mentre più distante, ma sempre nell'ambito urbano di Portoferraio, è la Scuola Primaria Battisti, che si trova nel centro storico, nella parte alta del paese, in prossimità della Villa Napoleonica dei Mulini. Tutti gli altri plessi sono situati in zone periferiche di Portoferraio ed in ordine crescente di distanza dalla sede principale sono:
• Scuola dell’Infanzia San Giuseppe (vecchio e nuovo edificio)
• Scuola di Carpani (ospitante parte delle classi del Tempo Pieno e la Scuola dell'Infanzia ex San Rocco) 
• Scuola a Tempo Pieno Casa del Duca
• Scuola dell’Infanzia San Giovanni